十萬級無塵車間針對以上干擾因素，應從設計、安裝、調試、運行等多方面來考慮壓差控制的穩定性問題，現就實際應用中控制方法問題討論如下
1、循環機組送回風量應滿足要求，并能自動調節，保證定值送風，即設計總風量需有一個調節余度，使用過程中風量減少空氣過濾器阻力增加時仍可自動調至需要的風量，而送風設定值，可在調試過程中，在靜壓差測試平衡的基礎上確定。
2、壓差的定值調節，建立在風量測試平衡的基礎上，即靜態時，在滿足室內換氣次數的前提下，自控回風閥開度設定高于50％時，能通過調節送回風手閥，使室內壓差接近于給定值，對一臺機組控制的房間數較多時，須在調試中特別注意，因支管風量的相互影響，此調試步驟是一個反復進行，逐步逼近設定值的過程，待所有房間經測試均達到要求時，方可固定送回風手閥，再投入壓差自控系統。
十萬級無塵車間對于一些凈化空調機組的功能段及其排列順序不應忽視，通常根據室內設備和圍護結構的空調負荷計算所得風量小于根據凈化級別所計算出來的循環風量，凈化空調系統的送風量應按滿足空調凈化級別所需要的設計的循環風量，凈化空調的新風量則是該系統設備排風量與維持系統正壓的風量之和，而恒溫恒濕空調系統的新風中可不考慮正壓風量。
十萬級無塵車間對于新風量很大（由設備排風引起，新風量大于循環風量的50％時）室內空調設計溫度低（室內外焾差大）的空調機組采用一個表冷段已無法確保設計出風量溫度，需采用二級表冷，即兩個表冷段同時與冷凍水系統并聯的方法，此時第二級表冷器的效率會很低，但為保證出風溫度是必要的，空調機組的中間段不可少，正壓區內的檢修門應為內開式以減少漏風，風機段與中效過濾段之間的中間段內需設均流板，以免風機出風口風速太高風量太集中將中效過濾袋吹破。